Матти Маасикас начал свою карьеру в государственной службе в 1996 году на должности руководителя департамента внешних связей парламента Эстонии. В 1999 году он был назначен главой кабинета премьер-министра Марта Лаара. Затем он работал в Министерстве иностранных дел Эстонии, сначала в качестве посла в Финляндии (2001-2005 годы), а затем (2005-2008 годы) – на должности генерального секретаря в Таллине. В 2009 году Матти Маасикас переехал в Брюссель, где присоединился к команде комитета по вопросам расширения, экономическим и валютным вопросам Олли Рена. Был постоянным представителем Эстонии при ЕС. В 2016-2019 гг. Маасикас работал в Таллинне на должности заместителя министра по вопросам ЕС в министерстве иностранных дел, в частности во время председательства Эстонии в Совете ЕС.

В августе 2019 господин Маасикас был назначен послом ЕС, главой Представительства ЕС в Украине.